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Cyrille Bonamy

Cyrille Bonamy


Ingénieur de recherche
Téléphone : 04.56.52.86.09
Courriel : Cyrille.Bonamy(A)legi.cnrs.fr
Bureau : G104

Depuis 2013 : Ingénieur de Recherche CNRS, Expert Calcul Scientifique au sein du laboratoire LEGI

2010 - 2013 : Responsable du Service Calcul Scientifique Intensif de l’Université Lille 1, et plus particulièrement en charge d’un cluster de plus de 2000 coeurs ( 50 Tflops)

Avant 2010 : Doctorat et Post Doctorat au sein du laboratoire de Poitiers PPRIME, thématiques de recherche (modélisation aéroacoustique)

Points clés de mon activité

ASPECTS RECHERCHE/CALCUL
- co-encadrement de la thèse de Tim Nagel "On the multi-scale interactions between a coupled atmosphere-ocean-sediment and a Marine Renewable energy (MRE) systems"
- co-développement de logiciels opensource dédiés aux expérimentateurs de la mécanique des fluides (FluidImage, FluidDyn, solveur SedFoam) ; langages C++ et Python
- optimisation des performances des outils de simulation et de traitement de données de l’ensemble des équipes de recherche du laboratoire ; langages C++, Fortran, C, Python et Matlab
- portage et aide à l utilisation des moyens de calcul régionaux (froggy - CIMENT) et nationaux (IDRIS - CINES et plus généralement GENCI)
- pilote dans le projet d’uniformiser les formats de données utilisés au sein du laboratoire LEGI, et plus particulièrement dans les codes de calcul locaux
- incitation et appui à l’utilisation des codes de calculs communautaires (OpenFoam, Saturn, ...) et aux techniques agiles de développement de codes (système de gestion de développement collaboratif de codes, versioning, intégration continue, tests de régression...)
- appui avancé développement aux stagiaires, doctorants et chercheurs (numériciens et expérimentateurs), en incitant fortement à l’usage du calcul intensif adapté à la situation (centre de calcul hpc, grille, cloud)
- co-animation du Groupe de Coopération Calcul du LEGI
- diffusion du savoir faire (séminaires, formation, forge publique sur les développements internes)
- veille technologique sur l’évolution des technologies de calcul intensif (GPU, cloud, bigdata, docker) ainsi que des concepts et des méthodes numériques dans le domaine de la mécanique des fluides numérique (école d’été MFN 2015, Porquerolles)

ASPECTS SYSTEME/INFRASTRUCTURE
- pilotage de l’opération ’Migration du Courriel’ (externalisation des courriels vers la DSI de l’Université Joseph Fourier, 2015) qui est quasi terminé
- pilotage des aspects infrastructure de la salle serveur du nouveau bâtiment du LEGI (optimisation des réglages de la GTC du bâtiment, référents des aspects maintenance et amélioration du système d’extinction incendie et de l’onduleur).
- participation à la gestion des machines de calculs sous Linux (500 coeurs) et des baies de stockage (>8, 300To)
- participation à la gestion des serveurs, équipements réseaux et services du Système d’Information du LEGI (>40 et 100% Debian GNU/Linux, intranet, extranet, forge, FTP, CIFS, IMAP, CalDav, SQL, inventaire, Ganglia, Flexlm, backup...). Plus de 900 points de monitoring Nagios à ce jour.
- participation à la gestion d’une partie des postes utilisateurs, principalement sous Debian GNU/Linux ( 80)
- gestion du système d’accès au bâtiment

ASPECTS AUTRES
- membre du GDS EcoInfo (GDS 3524)
- responsable technique du pôle PEM-ING-MATERIAUX de l’équipe CIMENT, et membre du pôle calcul de l’UMS GRICAD
- expert de jury BAP E pour les recrutements ITRF
- participation à divers projets recherche (ANR, projet STREAM-FAIRE de l’INP, projet région CMIRA)
- sauveteur Secouriste du Travail
- habilitation électrique BS
- vacations à l’Ecole d’Ingénieurs ENSE3 - GINP (TD et TP de Méthodes numériques et Mécanique des Fluides) ; montage d’une formation OpenFoam en seconde année.

Publications Recherche

2018

T. Nagel, J. Chauchat, A. Wirth, C. Bonamy (2018). On the multi-scale interactions between an offshore-wind-turbine wake and the ocean-sediment dynamics in an idealized framework – A numerical investigation, Renewable Energy, 01/2018 ; 115:783-796, https://doi.org/10.1016/j.renene.2017.08.078

2017

Julien Chauchat, Zhen Cheng, Tim Nagel, Cyrille Bonamy, and Tian-Jian Hsu (2017) SedFoam-2.0 : a 3D two-phase flow numerical model for sediment transport, Geoscientific Model Development, accepted, https://doi.org/10.5194/gmd-2017-101

2015

Ph. Debesse , L. Pastur, F. Lusseyran, Y. Fraigneau, C. Tenaud, C. Bonamy, A. V. G. Cavalieri, P. Jordan (2015). A comparison of data reduction techniques for the aeroacoustic analysis of flow over a blunt flat plate, J Theoretical and Computational Fluid Dynamics, 12/2015 ; p. 1-22, https://doi.org/10.1007/s00162-015-0375-4

2014

Diala Abu Awad, Sophie Gallina, Cyrille Bonamy, Sylvain Billiard (2014). The Interaction between Selection, Demography and Selfing and How It Affects Population Viability, PLoS ONE, 01/2014 ; 9(1):e86125, http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0086125

2013

C. Bonamy, C. Le Guyader (2013). Split Bregman iteration and infinity Laplacian for image decomposition, Journal of Computational and Applied Mathematics, 03/2013 ; 240:99-110, http://dx.doi.org/10.1016/j.cam.2012.07.008

2010

Cyrille Bonamy, Peter Jordan, Yves Gervais (2010). Tailored Nearfield Green’s Functions for Arbitrary Geometries, The Journal of the Acoustical Society of America, 11/2010 ; 128(5):2581-8, http://dx.doi.org/10.1121/1.3365240

Cyrille Bonamy, Peter Jordan, Yves Gervais (2010). Time-Domain Tailored Green’s Functions for Arbitrary Geometries, 16th AIAA/CEAS Aeroacoustics Conference, 06/2010, http://dx.doi.org/10.2514/6.2010-3906

2008

Cyrille Bonamy, Yves Gervais (2008). Experimental analysis of the wall aerodynamics and acoustic radiation of the trailing edge of an airfoil in subsonic flow, The Journal of the Acoustical Society of America, 06/2008 ; 123(5):3022

Actions "EcoInfo"

2017

C. Bonamy, R. David, J. Schaeffer : Audit de datacentre : explication par l’exemple - JRES 2017

plénière aux JDEV, Marseille, 2017 : Cyrille Boamy, Didier Mallarino. Impact des logiciels sur l’environnement, quid de l’eco-conception ?

Organisation et intervention lors de la journée EcoInfo “Edge Datacenters au coeur des services numériques de demain”, 16 Mars 2017, Paris

Organisation et intervention lors de la journée “Impact des logiciels sur l’environnement, quid de l’éco-conception ?”, 3 février 2017, Grenoble

2015

C. Bonamy, P. Billa, H. Meurdesoif (2015). Action "Développement Durable" au sein d’une DSI d’Université. JRES 2015

2014

Intervention succincte lors de la formation "Datacentres Eco-responsables : quoi de neuf ?", 2014